我院消化科（含内镜中心）为南京市消化病临床医学中心。消化科开展了包括食管、胃、肝脏、胆胰、肠道等各种消化系统常见病、多发病的专科和内镜综合诊断及治疗。重点针对肝硬化门脉高压引起的上消化道出血开展包括内镜、内科、介入、外科、ICU等多学科联动的综合诊疗，尤其在内镜治疗领域开展了内镜下胃曲张静脉精准断流术（ESVD)，结合套扎及常规硬化术，专科技术有一定水平。常规开展消化道早癌的内镜和内科综合治疗、胆胰疾病的ERCP综合诊疗。常规开展各种肝病诊治，针对不明原因黄疸的诊断及难治性黄疸及各型肝衰竭的临床治疗得心应手。